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超声医学工程省部共建国家重点实验室占地面积约2000余平方米，主要由HIFU工程实验室、HIFU声学检测实验室、分子生物学实验室、免疫组化实验室、动物手术实验室、生化实验室、病理切片室、细胞培养室、实验动物基地等组成。
实验室固定资产约4333万元，拥有显微穿刺操作系统、低温超速离心机、体式显微镜、JC-1型高强度聚焦超声肿瘤治疗系统、CZF-1型超声波妇科治疗仪、超声波终止早孕实验样机等先进的仪器和设备。此外，该实验室还拥有占地面积200平方米的实验恒河猴基地。
该所可为科技工作者提供多种形式的科研项目合作和超声治疗设备的研制。
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